MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GGA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016907	CGC	2	6	36	41	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016907	GGCC	2	8	75	82	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016907	GCG	3	9	147	155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016907	CGT	2	6	164	169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016907	CGT	2	6	189	194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720503
7	NC_016907	GCA	2	6	266	271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720503
8	NC_016907	CGG	3	9	329	337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720503
9	NC_016907	TGA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720503
10	NC_016907	ACG	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720503
11	NC_016907	AGG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720503
12	NC_016907	GAC	2	6	429	434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720503
13	NC_016907	TTGACC	2	12	466	477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378720503
14	NC_016907	GTG	2	6	532	537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720503
15	NC_016907	TCG	2	6	576	581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720503
16	NC_016907	TCC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720503
17	NC_016907	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720503
18	NC_016907	GTC	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720503
19	NC_016907	CGA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720503
20	NC_016907	ATC	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720503
21	NC_016907	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016907	GGT	2	6	714	719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016907	GCA	2	6	752	757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016907	CAT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016907	TCG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016907	CG	3	6	899	904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016907	CCGA	2	8	924	931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016907	ACC	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016907	GGT	3	9	961	969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016907	CGA	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016907	CCCG	2	8	1011	1018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016907	CGC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016907	TGG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016907	CGG	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016907	GCC	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016907	C	6	6	1173	1178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_016907	CGG	2	6	1263	1268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016907	GTT	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016907	GTT	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016907	GGT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016907	TCG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016907	GCC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016907	GCC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016907	GGCG	2	8	1461	1468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016907	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016907	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720504
47	NC_016907	GT	3	6	1516	1521	0 %	50 %	50 %	0 %	378720504
48	NC_016907	TGT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720504
49	NC_016907	GGT	2	6	1550	1555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720504
50	NC_016907	TCC	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720504
51	NC_016907	GGA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720504
52	NC_016907	TCG	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720504
53	NC_016907	GCC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720504
54	NC_016907	CTG	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720504
55	NC_016907	CAA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720504
56	NC_016907	GGT	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720504
57	NC_016907	GTGC	2	8	1863	1870	0 %	25 %	50 %	25 %	378720504
58	NC_016907	ACC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720504
59	NC_016907	GGA	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720504
60	NC_016907	CGG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720504
61	NC_016907	GTC	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720504
62	NC_016907	CGG	2	6	2082	2087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720504
63	NC_016907	AGT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720504
64	NC_016907	GGC	3	9	2210	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720504
65	NC_016907	TGT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720504
66	NC_016907	GATC	2	8	2251	2258	25 %	25 %	25 %	25 %	378720504
67	NC_016907	GTC	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720504
68	NC_016907	GTG	2	6	2354	2359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016907	CGA	2	6	2431	2436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720505
70	NC_016907	CG	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	378720505
71	NC_016907	TCG	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720505
72	NC_016907	GTC	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720505
73	NC_016907	GTG	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720505
74	NC_016907	ACC	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720505
75	NC_016907	AC	3	6	2665	2670	50 %	0 %	0 %	50 %	378720505
76	NC_016907	CAC	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016907	CTC	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016907	GCC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016907	GCGG	2	8	2783	2790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016907	ACG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016907	GAG	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016907	GGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016907	CGA	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016907	GCC	2	6	2924	2929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720506
85	NC_016907	ACC	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016907	TAC	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016907	AGCG	2	8	3127	3134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016907	CTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016907	GC	3	6	3293	3298	0 %	0 %	50 %	50 %	378720507
90	NC_016907	AAG	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720507
91	NC_016907	GCG	2	6	3360	3365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720507
92	NC_016907	TGG	3	9	3417	3425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720507
93	NC_016907	GCCG	2	8	3494	3501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016907	TCG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016907	GAG	3	9	3581	3589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016907	CTG	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016907	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016907	GTC	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016907	AAG	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016907	TCG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016907	GGCC	2	8	3792	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016907	CGG	2	6	3859	3864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016907	GT	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016907	GAG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016907	GCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016907	G	6	6	4020	4025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016907	GA	3	6	4027	4032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016907	GTG	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016907	CAG	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016907	ACG	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016907	CGT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016907	TCG	3	9	4255	4263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016907	CGC	3	9	4270	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016907	CAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016907	CGA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016907	GAT	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016907	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016907	TGG	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016907	GCTC	2	8	4503	4510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016907	GTCAC	2	10	4528	4537	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016907	TCAG	2	8	4552	4559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016907	ATC	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016907	TCG	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016907	CAG	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016907	GAA	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016907	GCA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016907	TGC	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720508
128	NC_016907	ACG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720508
129	NC_016907	GTA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720508
130	NC_016907	ACCA	2	8	4953	4960	50 %	0 %	0 %	50 %	378720508
131	NC_016907	TGC	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720508
132	NC_016907	CG	3	6	5045	5050	0 %	0 %	50 %	50 %	378720508
133	NC_016907	ACG	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016907	CGGC	2	8	5154	5161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016907	CGT	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016907	CGCT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016907	ACT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016907	GCC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016907	AGT	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016907	TGG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016907	GGT	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016907	GTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016907	CAG	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016907	GTT	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016907	GTT	2	6	5588	5593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016907	GCA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016907	TCT	2	6	5726	5731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016907	CTC	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_016907	CAG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016907	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016907	TCG	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016907	CTT	2	6	5829	5834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_016907	CGCC	2	8	6030	6037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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270	NC_016907	CA	3	6	11574	11579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_016907	CTC	2	6	11636	11641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_016907	AAT	2	6	11648	11653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_016907	AT	3	6	11652	11657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_016907	TAT	2	6	11662	11667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_016907	GGAT	2	8	11749	11756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_016907	TTGG	2	8	11767	11774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_016907	CGCC	2	8	11928	11935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
284	NC_016907	CCGA	2	8	11942	11949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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286	NC_016907	C	7	7	11996	12002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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300	NC_016907	CGC	2	6	12602	12607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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409	NC_016907	GGC	2	6	17294	17299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_016907	GC	3	6	17343	17348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
411	NC_016907	CCT	2	6	17350	17355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_016907	GAC	2	6	17375	17380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_016907	AC	3	6	17403	17408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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417	NC_016907	ATT	2	6	17576	17581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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